Postdoc en Bioinformatique au Pérou

Date de prise de poste : 2 janvier 2027

génomique environnementale biodiversité génomique et bioinformatique

Postdoctoral researcher in bioinformatics and genomics

Date de début : fin 2026 / début 2027

Lieu : Lima, Pérou

Avez-vous obtenu votre doctorat au cours des quatre dernières années ? Souhaitez-vous effectuer un postdoctorat à fort impact scientifique avec une dimension internationale en biodiversité néotropicale ?

Nous vous invitons à postuler à un poste postdoctoral au Laboratoire de Génomique et Bioinformatique pour la Biodiversité, de l’Institut des Sciences Biologiques « Antonio Raimondi » (Lima, Pérou), à l’Universidad Nacional Mayor de San Marcos, l’université la plus prestigieuse du pays et la plus ancienne d’Amérique.

Nous recherchons un/e chercheur/se ayant une expérience en bioinformatique appliquée à la biodiversité, incluant le métabarcoding ainsi que l’assemblage et l’annotation de génomes, afin de postuler conjointement à des financements nationaux visant l’intégration de chercheurs postdoctoraux dans des institutions péruviennes.

Projet de recherche

Le projet s’intitule « Power and promise of environmental genomics for Amazonian forest biodiversity monitoring ». Les plantes sont des composantes clés des écosystèmes amazoniens, soutenant les réseaux trophiques et les services écosystémiques. Cependant, leur suivi à grande échelle demeure difficile en raison de contraintes logistiques et taxonomiques.

Ce projet propose l’utilisation de la génomique environnementale (eDNA) pour le suivi de la biodiversité végétale à l’aide de technologies de séquençage à haut débit, en combinant les approches innovantes suivantes :

• Metabarcoding et génomique environnementale (séquençage massif)
• Capture ciblée par sondes (séquençage ciblé)
• Nanopore Adaptive Sampling
• Utilisation d’abeilles sans dart comme collecteurs naturels d’eDNA

Le projet sera mené en collaboration avec IRD-CNRS en Guyane française et comprend :

1. Développer des bases de données génomiques de référence pour les espèces végétales locales.
2. Mettre en place des systèmes d’analyse d’eDNA (à partir de ruches et filtres environnementaux).
3. Concevoir des pipelines bioinformatiques pour l’analyse du séquençage massif et de la capture ciblée.
4. Renforcer les capacités par la formation d’étudiants de master et des collaborations internationales.

Par ailleurs, des axes complémentaires sont envisagés, tels que le sequencage de genomes eucariotes, l’ADN environnemental chez les oiseaux ou le développement d’herbiers numériques à l’échelle nationale, selon le profil et les intérêts du/de la candidat/e.

Salaire

135 000 PEN pour 18 mois, soit l’équivalent de 1 892,42 €/mois.

Exigences

• Doctorat en génomique, bioinformatique ou domaines connexes
• Master en bioinformatique souhaité
• Expérience ou fort intérêt pour l’assemblage et l’annotation de génomes
• Publications antérieures, incluant des articles en premier auteur
• Bon niveau d’anglais à l’écrit et à l’oral (l’espagnol est souhaité)
• Capacité à travailler de manière autonome
• Disponibilité pour résider à Lima, Pérou pendant 18 mois

Procédure

Candidature: Envoyer une lettre de motivation, un CV, une liste d’articles et prépublications pertinentes ainsi que deux lettres de recommandation à Gisella Orjeda (Ver el correo electrónico en click.appcast.io). Appel ouvert jusqu’à pourvoir le poste.

Offre publiée

4 mai 2026, affichage jusqu'au 15 juin 2026

#J-18808-Ljbffr
Doctorat en génomique, bioinformatique ou domaines connexes, Master en bioinformatique
Bioinformatique appliquée à la biodiversité, Métabarcoding, Assemblage et annotation de génomes, Anglais écrit et oral
Développer des bases de données génomiques de référence., Mettre en place des systèmes d’analyse d’eDNA., Concevoir des pipelines bioinformatiques., Renforcer les capacités par la formation d’étudiants.